TecnoX 2017
Universidad de los Andes.
simbiosys.
(Simulator of Biological Systems)
¿De qué se trata?
Este es uno de los orgullos de Biología Sintética Uniandes para el TecnoX-2017, un pedazo de tecnología de libre acceso que encaja perfectamente con el principal objetivo de nuestro equipo para este año, ayudar a democratizar la ciencia. Esta propuesta surge a partir de una dificultad que hemos experimentado como grupo multidisciplinario: sucede que muchas veces para poder acceder a una herramienta que de antemano sabemos que es útil, es necesario tener primero un bagaje de conocimientos técnicos o teóricos que no son de nuestro campo de acción; así, en nuestro caso, un estudiante que no sabe de computación, ni mucho de matemáticas, difícilmente podrá beneficiarse de las ventajas que ofrece el modelado por razones ajenas al interés ¡el problema está en los requisitos previos para acceder a la herramienta!
De esta forma, el equipo de modelos decidió dar un primer paso para derribar esta
barrera, y creó simbiosys. Este es un paquete completo que esperamos le permita a cualquier persona, sin ningún tipo de conocimiento previo, realizar sus propios modelos matemáticos y simular su evolución de forma computacional; solo hace falta un acceso a internet, saber sumar, y saber escribir. El paquete incluye tres etapas de suma importancia que serán explicadas a continuación.
Etapa 1: Con tus propias manos.
Esta etapa tiene forma de folleto. Basándonos en el trabajo realizado por el equipo de Biología Sintética Uniandes del 2014, el de este año diseñó un folleto informativo cuyo único fin es guiar a la persona que lo lea para que reduzca a ecuaciones diferenciales procesos biológicos complejos. No es necesario saber resolver este tipo de ecuaciones, ni siquiera es vital que la persona tenga una comprensión profunda de lo que es una derivada: el folleto empieza desde cero, y termina con las ecuaciones.
Cabe resaltar, que si bien el proyecto está enfocado en el modelado dentro de la biología
sintética, los principios utilizados fácilmente abarcan desde fenómenos económicos hasta procesos atmosféricos: si se puede expresar como una ecuación, se puede simular.
El documento lo pueden encontrar haciendo click sobre nuestro fabuloso logotipo justo
debajo de este comentario.
Etapa 2: Le toca a simbiosys.
Esta etapa tiene forma de página web. Nuestro equipo puso horas de trabajo y frustración en crear un código capaz de interpretar lo conseguido en la Etapa 1, resolver las ecuaciones, y organizar los resultados. Esto quiere decir que alguien interesado en hacer un modelo de su sistema ¡lo puede ver evolucionar sin escribir una sola línea de código, ni saber lo que significa una ODE!
Naturalmente, nuestro equipo no quisiera desalentar a aquellos que desean empaparse de
estas técnicas y conocimientos que resultan tan útiles, es solo una forma de llevar esta herramienta a aquellas personas que por diversos motivos no pueden tener tal inmersión, ¿no deberían tener también la oportunidad de aprovechar el modelado matemático y sus ventajas? ¡Por supuesto que sí! Ahora lo pueden hacer.
No quisiéramos aburrirlos escribiendo tanto, lo mejor es que vean a nuestro tesoro en
acción haciendo click sobre nuestro fabuloso logotipo justo debajo de este comentario.
Etapa 3: La ciencia sigue.
Esta etapa tiene la forma que tenga la felicidad. Ya tienes tu modelo: simbiosys te entregó las gráficas de la evolución de tus parámetros, y un archivo con los resultados que se graficaron; ahora te toca a ti utilizar esta información para seguir haciendo ciencia, aprovecha lo que obtuviste y sé feliz.